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Biotecnologia Rações funcionais Diagnósticos +10 mais

As tecnologias de sequenciamento de última geração e a metagenômica estão provando seu valor entre os primeiros a adotar a aquicultura - em especial os operadores de RAS - de acordo com Matthew Pope, fundador e diretor administrativo da Esox Biologics.

por Senior editor, The Fish Site
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Matthew Pope, fundador e diretor administrativo da Esox Biologics, coletando uma amostra

A empresa fornece aos fazendeiros ensaios de diagnóstico para identificar e detectar patógenos causadores de doenças antes de fornecer aditivos alimentares personalizados que modulam positivamente os microbiomas de animais aquáticos para inibir o crescimento dos patógenos detectados © Esox Biologics

Pode me contar um pouco sobre sua formação?

Nascido em Londres, Reino Unido, filho de mãe irlandesa e pai canadense. As férias escolares eram passadas em cada país, onde estabeleci minha paixão por peixes, pesca e o mundo aquático. Todos os dias eu passava perto da água: observando a truta subir, caçando lagostins ou tentando atrair um almiscarado indescritível das profundezas de um lago de água doce intocado.

O que o inspirou a começar a pesquisar sobre patógenos aquáticos?

Tenho formação como microbiologista e trabalhei por dez anos em empresas e instituições de pesquisa na França, Holanda, Reino Unido, Japão e Argentina. Cada laboratório estava desenvolvendo novas soluções biotecnológicas para tratar doenças em seres humanos ou melhorar processos industriais. Eu estava aprendendo e ajudando a desenvolver tanta tecnologia fascinante, mas nunca perdi minha paixão pelos peixes e pelo mundo aquático. Tendo visto em primeira mão o poder da biotecnologia moderna, eu queria saber se sua aplicação à medicina veterinária aquática também poderia melhorar o bem-estar dos animais aquáticos.

Quais produtos e serviços a empresa está oferecendo?

Na Esox Biologics, temos a missão de evitar a disseminação de doenças infecciosas entre os animais aquáticos. Fazemos isso fornecendo ensaios de diagnóstico para identificar e detectar patógenos causadores de doenças e, em seguida, fornecemos aditivos para rações personalizados que modulam positivamente os microbiomas de animais aquáticos para inibir o crescimento dos mesmos patógenos que detectamos.

O que faz com que esses serviços se destaquem dos meios tradicionais de avaliação de riscos de doenças e mitigação desses riscos em instalações de aquicultura?

Nossos serviços de diagnóstico diferem dos produtos convencionais porque aproveitamos as tecnologias de sequenciamento de última geração e alavancamos a ciência da metagenômica. Os diagnósticos convencionais, como os ensaios de qPCR, detectam apenas patógenos conhecidos e oferecem um resultado binário (patógeno presente/ausente). A histologia pode identificar a patologia, mas oferece poucas informações sobre a identificação do culpado.

Nosso serviço de metagenômica revela a população total de microrganismos em uma amostra. Noventa por cento dos microrganismos aquáticos não são classificados, o que significa que não são descritos pela ciência. Nossas plataformas metagenômicas identificam todos os organismos e os caracterizam taxonomicamente, além de identificar possíveis patógenos a partir de suas sequências de DNA exclusivas.

O kit de amostra eForesee da empresa

O diagnóstico aquático da Esox aproveita o poder do sequenciamento metagenômico para decifrar a complexidade dos microbiomas totais a partir de uma única amostra © Esox Biologics

Como os agricultores podem usar seus produtos e serviços para ajudar a prevenir surtos de doenças?

Nossos serviços de diagnóstico estão sendo implementados em programas de vigilância. Os produtores nos enviam amostras que coletam regularmente e usam os dados resolvidos do microbioma para inferir como suas táticas atuais de criação podem ser aprimoradas e como as condições ambientais em suas fazendas influenciam positiva e negativamente os microbiomas das fazendas e, portanto, as ameaças de doenças.

Nossa linha de prebióticos inibidores de patógenos ainda não está disponível comercialmente, mas será incorporada às formulações de ração existentes e aplicada diretamente aos animais, sem nenhuma mudança nas práticas do produtor.

Por que a análise metagenômica é particularmente útil para os operadores de RAS?

Operadores de RAS dependem de filtros biológicos para reciclar e sequestrar produtos residuais nocivos que se acumulam em um ciclo de produção. Esses biofiltros são adquiridos comercialmente e são compostos por micróbios com capacidades metabólicas conhecidas. Os produtores de RAS usam biofiltros, mas atualmente não têm conhecimento de como essas comunidades microbianas flutuam ao longo do tempo e como essas flutuações afetam seus rebanhos ou as propriedades físicas e químicas da água. Atualmente, a saúde do biofiltro é medida por aproximação, monitorando os níveis de amônia, por exemplo.

Os produtores de RAS estão usando nosso serviço de metagenômica para monitorar os microbiomas de seus biofiltros ao longo do tempo e correlacionar esses dados com os dados de produção para obter insights valiosos sobre como podem melhorar suas práticas.

Existe algum outro elemento do setor de aquicultura para o qual seus produtos/serviços seriam mais adequados ou eles são adequados para todas as escalas, orçamentos e espécies?

Nossa especialidade é a microbiologia aquática. Todos os ambientes aquáticos - sejam eles internos, interiores ou offshore - têm microbiomas. Nossa tecnologia é aplicável a todos os formatos de produção; temos clientes que produzem moluscos em RAS, peixes ósseos em alto-mar, peixes ósseos em terra firme com raceways e fazendas RAS e produtores de crustáceos usando tanques revestidos.

O que você aprendeu com os testes de sua tecnologia?

As informações mais valiosas que nossos testes revelaram é que, em cada ambiente aquático, mais de noventa por cento dos microrganismos não são classificados. Estamos no limiar da próxima fronteira da biologia: a maioria dos micróbios aquáticos não caracterizados.

Bactéria Vibrio vista em um microscópio

Noventa por cento dos microrganismos aquáticos não são classificados, mas as plataformas metagenômicas da Esox identificam todos os organismos e os caracterizam taxonomicamente antes de identificar possíveis patógenos a partir de suas sequências de DNA exclusivas

Que feedback vocês tiveram dos primeiros usuários do setor?

Os agricultores que utilizam nossos serviços têm tempo limitado para procedimentos complexos de amostragem, por isso simplificamos drasticamente nossa estratégia de amostragem, e eles também se preocupam menos com os detalhes microbiológicos e mais com os insights acionáveis que podem ser obtidos a partir deles. Adaptamos nossos relatórios de acordo com isso, para garantir que os agricultores obtenham as informações mais úteis e aplicáveis.

Entretanto, nossos primeiros veterinários adotantes querem o máximo de dados possível e estão entusiasmados com a capacidade da metagenômica de preencher a lacuna que existe atualmente entre os ensaios de diagnóstico molecular e os ensaios visuais baseados em histologia. Um exame histológico pode revelar uma patologia, mas se o patógeno nunca tiver sido caracterizado, ele não será detectado com a linha usual de ensaios de qPCR. A metagenômica revela os culpados atualmente não acessíveis pelos diagnósticos convencionais.

Fazenda RAS interna

Os produtores de RAS estão usando o serviço de metagenômica da Esox Biologics para monitorar os microbiomas de seus biofiltros ao longo do tempo e correlacionar esses dados com os dados de produção para obter informações valiosas sobre como podem melhorar suas práticas

Com que rapidez os agricultores podem esperar um retorno sobre seus investimentos se usarem seus produtos e serviços?

Se o cliente quiser identificar um possível patógeno que os ensaios atuais não conseguem identificar, o retorno do investimento é imediato. Se um cliente quiser saber como os microbiomas de suas instalações de produção são afetados por seus métodos de criação, regime de alimentação ou estratégia de tratamento, ele terá que esperar que o ciclo completo de produção seja concluído ou que o período completo de amostragem seja concluído antes de poder correlacionar os dados metagenômicos com seus metadados de produção e chegar a conclusões esclarecedoras. Independentemente disso, um investimento em vigilância metagenômica agora produz insights acionáveis para a produção do próximo ano.

Como você vê a evolução da empresa nos próximos anos?

Nossos produtos se tornarão mais personalizáveis com o tempo. À medida que continuarmos a coletar mais dados sobre os microbiomas aquáticos, poderemos fornecer insights mais exclusivos para esses locais de produção, sejam eles ensaios de diagnóstico exclusivos para detectar patógenos presentes apenas em fazendas específicas ou para desenvolver prebióticos exclusivos que modulem os patógenos encontrados nos microbiomas de animais específicos.

Como a empresa foi financiada até o momento e vocês têm planos de obter mais financiamento?

Nossa empresa é apoiada por capital de risco e agora está gerando receita por meio de nossos serviços de diagnóstico. Esperamos um crescimento contínuo à medida que mais clientes adotem nossos serviços e experimentem nosso valor, aumentando o rendimento das fazendas ao melhorar o bem-estar dos animais.

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